于暗发酵至多只能将1mol葡萄糖生成4mol氢气和2mol乙酸，故其很难应用于实际生产中。而光营养细菌可以将有机酸等底物完全转化为氢气，所以此后生物制氢的研究基本上都集中于光发酵。20世纪80年代初在世界范围内研究与发展计划（RD）对可再生能源的支持逐渐减少。到90年代早期，环境问题日益严重，又使人们将注意力集中到可替代能源上。在德国、日本、美国生物制氢RD的支持下，藻类利用光能从水中制取氢气这一领域得到了广泛的研究。然而，这一过程中总的太阳能转化效率仍然很低。另一方面，暗发酵和光营养细菌可以从低成本的底物或有机废物